Расійскія біёлагі прапанавалі змагацца з чорнай ножкай пры дапамозе вірусаў-бактэрыяфагаў, якія знішчаюць спецыфічныя віды бактэрый, але не шкодзяць бульбе і чалавеку. Вынікі дадзенага даследавання апублікаваныя у часопісе Вірусы.
Фагавыя кактэйлі (сумесі розных бактэрыяфагаў) выкарыстоўваюцца ў сельскай гаспадарцы супраць хвароб раслін. З іх дапамогай можна скараціць страты з-за псуты прадукцыі. Але пакуль спробы абараніць бульбу ад мяккай гнілі не ідуць далей за лабараторную прабірку і мадэльныя штамы, а такія ўмовы адрозніваюцца ад рэальных. Каб вырашыць гэтыя праблемы, неабходна дакладна вызначыць спіс патагенных бактэрый, шкодных для бульбы. Затым - адабраць фагі, якія лепш за ўсё з імі спраўляюцца, вылучыць іх у чыстай культуры, распрацаваць і запусціць тэхналогію іх ужывання ва ўмовах сховішчаў. Навукоўцы з Расійскага ўніверсітэта дружбы народаў правялі даследаванне па гэтай тэме.
«Каб прымяняць фагавы кактэйль супраць мяккай гнілі ў прамысловых маштабах, трэба адказаць на мноства пытанняў па геноміцы бактэрый. Пектабактэрыі і вірусаў, якія спецыялізуюцца на іх, лепш зразумець малекулярна-біялагічныя асновы іх узаемадзеяння. Таксама трэба разабрацца з тэхнічнымі дэталямі - вытворчасцю кактэйлю і формай яго прымянення і атрымаць дазволы на заканадаўчым узроўні. Наша даследаванне дапаможа вырашыць гэтыя праблемы», - распавёў прафесар аграбіятэхналагічнага дэпартамента РУДН, доктар біялагічных навук, Аляксандр Ігнатаў.
Навукоўцы з РУДН разам з калегамі з Даследчага цэнтра "ФітаІнжынерыя", Інстытута біяарганічнай хіміі РАН, а таксама МДУ сабралі здзіўленыя ўзоры бульбы з прамысловых сховішчаў для вызначэння асноўных патагенных бактэрый.
Штамы адрознівалі з дапамогай ПЦР-тэсту і па варыяцыях у паслядоўнасці гена 16S рРНК. Навукоўцы высветлілі, што штамы, якія па вонкавым выглядзе ставіліся да Pectobacterium carotovorum, на самой справе належалі да нядаўна вызначанага выгляду Pectobacterium versatile. Акрамя яго, самымі распаўсюджанымі аказаліся штамы. Pectobacterium brasilense и Pectobacterium polaris, якія часта сустракаюцца на палях Цэнтральнай і Усходняй Еўропы. А вось Pectobacterium atrosepticum і прадстаўнікоў роду Дзікея, якія выклікалі ўспышкі захворванняў у пачатку двухтысячных гадоў, ва ўзорах не аказалася. Мікрабіёлагі пратэставалі на гэтых штамах 50 бактэрыяфагаў і адабралі самыя эфектыўныя. Пры гэтым навукоўцы па геномым паслядоўнасцям вызначылі вірусы, якія будуць знішчаць бактэрыі, а не проста заражаць іх, убудоўвацца ў іх геном і пераходзіць у "спячы рэжым". Кактэйль праверылі ў прамысловым сховішчы бульбы ў аграпарку «Рагачова». Клубні апрацоўвалі раз на тыдзень на працягу шасці месяцаў. У выніку рост фітапатагенных бактэрый на клубнях знізіўся ў 10-12 разоў.