Даследнікі з Кітая і Нямеччыны ўпершыню цалкам расшыфравалі геном бульбы, паведамляе ТАСС. Гэта дапамагло ім расчыніць гісторыю эвалюцыі гэтай расліны і вылучыць ключавыя ўчасткі ДНК, злучаныя з ростам і ўстойлівасцю да хвароб. Інфармацыю аб гэтым апублікавала прэс-служба нямецкага Інстытута селекцыі раслін (IPZ).
"Расшыфроўка геному бульбы дазволіць нам запусціць высокаэфектыўныя праграмы па селекцыі, якія дазволяць стварыць новыя гатункі, якія валодаюць высокай ураджайнасцю і пры гэтым устойлівыя да глабальнага пацяплення, што стане крытычна важным у бліжэйшыя дзесяцігоддзі", – заявіў прафесар IPZ Карбініян Шнеебергер.
Вырошчванню бульбы перашкаджаюць многія грыбныя і бактэрыяльныя хваробы, а таксама розныя шкоднікі, такія як каларадскі жук і нематоды. Навукоўцы і селекцыянеры спрабуюць змагацца з імі, ствараючы новыя гатункі звычайнай і генна-мадыфікаванай бульбы.
Прафесар Шнеебергер і яго калегі атрымалі патэнцыйнае рашэнне для гэтай праблемы ў рамках маштабнага праекту, накіраванага на поўную расшыфроўку геному бульбы. У мінулым навукоўцы ўжо спрабавалі атрымаць гэтыя звесткі, аднак гэтаму перашкаджала вельмі складанае прылада геному бульбы – ён складаецца з чатырох ідэнтычных набораў храмасом, якія змяшчаюць у сабе вялікі лік паўтораў.
Новыя тэхналогіі секвеніравання ДНК і алгарытмы аналізу генетычнай інфармацыі дапамаглі нямецкім і кітайскім генетыкам вырашыць гэтую задачу для гатунку Отава. Для расшыфроўкі геному навукоўцы сабралі вялікую колькасць пылковых зерняў, чый генетычны матэрыял утрымлівае ў сабе толькі дзве, а не чатыры копіі храмасом.
Падобны падыход значна спрасціў задачу, але пры гэтым ён запатрабаваў расшыфроўкі вельмі вялікай колькасці фрагментаў ДНК і іх наступнага аб'яднання пры дапамозе кампутарных алгарытмаў. У канчатковым выніку навукоўцы атрымалі віртуальную копію поўнага геному бульбы, які складаецца з прыкладна 3,1 млрд. генетычных «літар»-нуклеатыдаў і ўтрымоўвае ў сабе звыш 38 тыс. генаў.
Наступны аналіз іх структуры раскрыў няпростую эвалюцыйную гісторыю бульбы. Навукоўцы выявілі, што гэтая культура адносна нядаўна перажыла падваенне геному ў выніку блізкароднаснага скрыжавання. У дадатак, навукоўцы раскрылі незвычайныя адрозненні ва ўзроўні актыўнасці дзід адных і тых жа генаў, размешчаных у розных храмасомах, патэнцыйна ўплываюць на эфектыўнасць скрыжавання розных гатункаў бульбы.
Гэтыя звесткі, як спадзяюцца навукоўцы, дапамогуць вывесці новыя гатункі або мадыфікаваць геном такім чынам, што бульба будзе хутчэй расці, лепш супраціўляцца фітафтора і іншым хваробам, а таксама будзе менш схільны дзеянню розных стрэсавых фактараў.